Принимая во внимание, что люди используют глаза и уши для получения информации, клетки полагаются на протеины, охватывающие их наружные мембраны для просмотра для химических сигналов от внешнего мира. Теперь пусковые планы биотехнологии начать международный консорциум для определения трехмерных кристаллических структур 100 таких мембранных протеинов, многие из которых представляют многообещающие цели препарата.
Несколько «структурной геномики» усилия были начаты недавно для автоматизации атомного картографирования протеинов, но это является первым для концентрации на мембранных протеинах. Предметами является класс протеинов по имени G соединенные с протеином рецепторы, которые чувствительны к стимулам, столь же различным как гормоны и измененные фотоном пигменты. Как только эти протеины обнаруживают определенный сигнал вне клетки, они выпускают каскад биохимических посыльных, изменяющий химию или экспрессию гена клетки. Ученые хотели бы знать больше деталей, но рецепторы являются общеизвестно трудными работать с. Удаление их от клеточной мембраны разрушает их нормальную 3D форму и любую надежду на понимание, на что они похожи в атомных деталях.
Консорциум, во главе с пусковым Bio-Xtal в Рубе, Франция, планирует организовать совместное усилие для нахождения новых способов выразить, кристаллизовать, и изображение протеины. Если все пойдет как запланировано, то начинающий в апреле компанию будет сотрудничать с четырьмя академическими лабораториями во Франции, Германии и Нидерландах. Bio-Xtal относился к Европейскому союзу за половину приблизительно стоимости ($9,3 миллионов) в размере 10 миллионов евро 3-летнего проекта, и это ожидает поднимать остальных от фармацевтических спонсоров. Семнадцать компаний, включая Скалу, Мерк, и Astra Zeneca, уже предложили поддержку, говорит Этьенн Л’Эрмит, менеджер Био-Кстэла.
Усилие расширить структурную геномику на мембранные протеины «превосходная идея», говорит Алед Эдвардс, структурный биолог в университете Торонто. Но потому что мембранные протеины трудно выразить и кристаллизовать – два необходимых шага в определении их структуры – проект несомненно будет стоять перед медленным движением, говорит он. «Запрос чего-то, ‘геномика’ подразумевает автоматизацию и высокую пропускную способность», говорит Эдвардс. В этом случае, «это – что-то вроде протяжения».