ВАШИНГТОН, D.C. – Скромная дрозофила взяла на себя инициативу на гонке генома. Используя подход, публично наказанный меньше чем 2 года назад, общественно-частное сотрудничество практически закончило упорядочивать геном организма, самое большое, сложенное в мешок до сих пор. О подвиге объявили здесь сегодня на годовом собрании Американской ассоциации содействия развитию науки, издающей ScienceNOW.Геномика Celera в Роквилле, Мэриленд, работающий с учеными из нескольких академических центров, определила 97% 120 миллионов основ, составляющих содержащие ген регионы генома Дрозофилы – процент, который согласовывают много исследователей, достаточно высоко для рассмотрения работы сделанной.
Большинство остающихся 3% должно быть закончено за следующие несколько месяцев, сказал Марк Адамс Селеры. Остальная часть генома, приблизительно 60 миллионов основ, содержит повторяющуюся и некодирующую ДНК, которая является вне досягаемости технологии упорядочивания потока и менее интересна для исследователей.Изучение мутаций у дрозофил помогло генетикам понять, как гены работают в течение почти века.
В последние годы они поняли, что многие из тех генов имеют копии в других организмах, включая людей, делая дрозофилу еще более ценным инструментом исследования. Наличие последовательности дрозофилы «собирается преобразовать способ, которым мы проводим исследование», говорит генетик Лоуренс Голдстайн из Калифорнийского университета (UC), Сан-Диего.
Успех Селеры у дрозофилы может помочь убедить скептиков полноценности «целого подхода ружья генома компании», в котором ДНК организма расколота в бесчисленные маленькие части для упорядочивания и затем повторно собрана мощным компьютером. Когда президент Celera Дж.
Крэйг Вентер объявил в мае 1998, что намеревался упорядочить геном человека этот путь, конкурирующие ученые генома были очень скептичны. Многие предсказали, что Вентер будет неспособен соединить миллионы частей назад правильно, и что много промежутков остались бы в законченной последовательности. Но частично благодаря компьютерной программе, развитой Celera bioinformaticist Джин Майерс, подход «работал лучше, чем кто-либо ожидал», говорит генетик УКА Беркли Геральд Рубин.
Приблизительно 1 600 промежутков остаются в последовательности, но уже находящие ген компьютерные программы и другие исследования предполагают, что у дрозофилы могли быть целых 13 000 генов. Исследователи понятия не имеют о функции почти половины из них, сказанный Адамс.
Но некоторые главные гены «высунули право», добавил он, такие как давно разыскиваемая дрозофила, эквивалентная из гена-супрессора опухоли p53. И наличие последовательностей всех генов, говорит Голдстайн, собирается сделать исследование «катапультой вперед».